Los coeficientes parciales de endogamia, Fij, miden la probabilidad de que los alelos estén en una localización arbitraria en un individuo i sean idénticos por descendencia y que los alelos fueran derivados desde un alelo en un fundador j. Los coeficientes de endogamia parcial del ancestro de un individuo pueden ser vistos como su "contribución" a este individuo COI, p.e., en un pedigrí completo la suma de todos los COIs parciales de todos los ancestros del individuo deben igualar al del individuo COI!
Los ancestros contribuyen lo máximo a un individuo COI no tienen automáticamente el porcentaje endogámico más alto. Por ser un familiar cercano (abuelo, bisabuelo) un animal con un bajo porcentaje endogámico podría tener un factor colaborador más grande que otros animales con un porcentaje endogámico más alto. El animal que usted seleccionó para un análisis del pedigrí tendrá más en común con los ancestros teniendo el más alto coeficiente parcial de endogamia .
Por favor anote: El cálculo parcial COI está disponible solo hasta la 5ª generación como requerimientos computacionales son demasiado altos para pedigrís más grandes.